Paskaidrots: kuri ir Covid-19 varianti Indijā, un vai tie izskaidro pieaugumu?

Ir konstatēts, ka vairāk nekā 320 koronavīrusa paraugiem ir Apvienotās Karalistes izcelsme Pendžabā. Vai tas izskaidro neseno pieaugumu? Un cik plaši izplatīti ir Dienvidāfrikas un Brazīlijas varianti, izņemot citus Indijā?

Tirdzniecības centrā Punē (Express Photo: Ashish Kale, File)

Ir konstatēti vairāk nekā 320 koronavīrusa paraugi no Pendžabas Apvienotās Karalistes ciltsraksts , atsauce uz jaunu vīrusa celmu, kas decembrī parādījās Apvienotajā Karalistē ar ģenētiskām mutācijām, kas ļāvušas tam izplatīties ātrāk. Šī ir visizplatītākā Apvienotās Karalistes varianta sastopamība Indijas populācijā, kas līdz šim konstatēta, un, iespējams, varētu izskaidrot straujo gadījumu pieaugumu Pendžabā pēdējo nedēļu laikā.

Biļetens| Noklikšķiniet, lai savā iesūtnē iegūtu dienas labākos skaidrojumus

jeffree zvaigžņu māja calabasas

Trešdienas valdības paziņojumā teikts, ka līdz šim ir konstatēti 736 paraugi no visas valsts, kuriem ir Apvienotās Karalistes izcelsme. Neatkarīgi no tiem tika konstatēts, ka 34 paraugiem ir Dienvidāfrikas izcelsme, un vienam bija Brazīlijas izcelsme. Dienvidāfrikas un Brazīlijas varianti ir divi citi dominējošie koronavīrusa celmi, kas cirkulē visā pasaulē. Ģenētiskās mutācijas šajos divos variantos liek tiem izbēgt no cilvēka imūnsistēmas. Tāpēc pastāv bažas, ka pašreizējās vakcīnas varētu būt salīdzinoši mazāk efektīvas pret tām, lai gan tas joprojām tiek izmeklēts.

Varianti Indijā

Apvienotās Karalistes, Brazīlijas un Dienvidāfrikas varianti nav vienīgie, kas pašlaik cirkulē Indijas iedzīvotāju vidū. Tāpat kā jebkurš cits organisms, arī koronavīruss pastāvīgi mutē, un katrā replikācijas ciklā notiek dažas izmaiņas tā ģenētiskajā struktūrā. Lielākā daļa no šīm mutācijām ir nenozīmīgas un nemaina koronavīrusa vispārējo raksturu vai uzvedību. Taču daži no tiem, iespējams, viens no tūkstošiem, var ieviest svarīgas izmaiņas, palīdzot vīrusam labāk pielāgoties vai izdzīvot.

Šīs epidēmijas laikā tiek rūpīgi vērotas trīs veidu izmaiņas — tādas, kas palielina vīrusa spēju ātrāk izplatīties, tās, kas izraisa smagākas saslimšanas inficētajā cilvēkā, un tādas, kas palīdz vīrusam izvairīties no imūnās atbildes.

Apvienotās Karalistes, Brazīlijas un Dienvidāfrikas varianti ir šādi celmi. Katrai no tām tagad ir savas ģimenes, kas nozīmē, ka tajās ir notikušas daudzas turpmākas mutācijas, bet sākotnējā definējošā mutācija ir palikusi neskarta. Šīs trīs ģimenes vai izcelsmes varianti ir atrasti vairākās valstīs, un tās galvenokārt ir atbildīgas par gadījumu pieaugumu Eiropā un Brazīlijā.

Bez tiem Indijas populācijā cirkulē vairāki citi varianti, tādi, kuriem ir radās lokāli kā arī citas, kuras atveduši ceļotāji no ārzemēm. Bet neviens no tiem nav klasificēts kā variants, kas rada bažas.

Indijā konstatēti Covid-19 varianti

Apvienotās Karalistes Covid-19 variants un bažas

Zinātnieki ir apgalvojuši, ka nevienu no trim “bažas satraucošajiem variantiem” — Apvienotās Karalistes, Brazīlijas vai Dienvidāfrikas — nevar saistīt ar pašreizējo gadījumu skaita pieaugumu Indijā. Viņu izplatības līmenis sabiedrībā šobrīd nav tik augsts, lai pašreizējo pieaugumu varētu attiecināt uz viņiem.

Pat Pendžabā, kur 80% no 400 analizētajiem paraugiem izrādījās Apvienotās Karalistes variants, ir pāragri to vainot ārkārtējā gadījumu skaita pieaugumā pēdējo nedēļu laikā. Genoma sekvencēšanas rezultāti tagad ir atklāti, un ir jāveic klīniska korelācija, lai novērtētu, vai tie ir atbildīgi par gadījumu pieaugumu.

Kā norādījuši zinātnieki, ja visi cilvēki, kas Pendžābā ir inficēti ar Apvienotās Karalistes celmu, ir ceļotāji vai viņu tiešie kontakti, tad viņu parādības var viegli izskaidrot, un tas nav pārāk satraucošs. Taču, ja tas ir konstatēts cilvēkiem arī plašākā sabiedrībā, tad pastāv risks, ka tas ļoti ātri izplatīsies arī uz citiem. Tas arī nozīmētu, ka valstī noteiktās izolācijas un karantīnas procedūras, īpaši ceļotājiem, nav tikušas ievērotas pārāk stingri.

cik vērts ir Dženifera mīlestība Heivita

Dažas specifiskas mutācijas, kas atrastas Apvienotās Karalistes celmā, piemēram, viena ar nosaukumu E484Q un otra ar nosaukumu N440K, ir novērotas arī dažos citos variantos, un tās ir cirkulējušas Indijas populācijā vairākus mēnešus. Pašlaik nav pierādījumu, kas liecinātu, ka kāds no šiem gadījumiem varētu izraisīt otro pieaugumu vai izraisīt atkārtotu inficēšanos pacientiem.

Tomēr ir nepieciešami daudz detalizētāki zinātniski pētījumi, lai novērtētu to ietekmi uz slimības izplatību Indijā.

Genoma sekvencēšana…

Indijā epidēmijas laikā ir otrs lielākais ar koronavīrusu inficēto cilvēku skaits. Bet tas ir izveidojis ļoti maz dažādu apritē esošo variantu genomu sekvences. Līdz šim tā ir veikusi gēnu analīzi 19 092 paraugiem no visas valsts, teikts valdības pagājušajā nedēļā parlamentā sniegtajā paziņojumā. Tas ietver 10 787 paraugu sekvencēšanu, kopš valdība decembrī īpaši šim nolūkam izveidoja INSACOG (Indijas SARS-CoV2 genomikas konsorciju). Daudzas citas valstis, tostarp ASV un Ķīna, ir analizējušas vairāk nekā 100 000 gēnu sekvences.

Ģenētisko izmaiņu izpēte organismā ir svarīgas norādes, lai izprastu vīrusa izcelsmi, pārnešanu un ietekmi uz pacientiem. Noteiktais INSACOG mērķis ir desmit laboratoriju tīklā veikt paraugu sekvencēšanu no vismaz 5% no visiem inficētajiem gadījumiem. Šobrīd tas izskatās pēc ļoti liela pasūtījuma. Indija līdz šim ir reģistrējusi vairāk nekā 1,17 miljardus pozitīvu gadījumu. 19 092 paraugi, kas līdz šim ir sekvencēti, veido tikai 0,16% no šī skaita.

PIEVIENOJIES TAGAD :Kanāls Express Explained Telegram

... un kāpēc tas ir bijis lēns

selenis leyva neto vērtība

Viens no galvenajiem iemesliem lēnajam genoma sekvencēšanas tempam ir bijis līdzekļu trūkums. Līdz šim nauda INSACOG nav piešķirta, lai gan amatpersonas teica, ka līdzekļu apstiprināšana tagad ir gaidāma jebkurā dienā. Laboratorijas ir izmantojušas naudu no sava gada budžeta, lai veiktu secības darbu. Viena parauga gēnu secības iegūšanai ir nepieciešami no 3000 līdz 5000 Rs. Izmaksas galvenokārt veido ķīmiskie reaģenti, kas nepieciešami procesā.

Arī valstis nav aktīvi nosūtījušas savus paraugus uz laboratorijām sekvences noteikšanai. Saskaņā ar parlamentā iesniegtajiem valdības datiem, Maharaštra, kurā līdz šim ir reģistrēti vairāk nekā 25 000 000 infekciju, ir nosūtījusi tikai aptuveni 2800 paraugu sekvencēšanai. Tas ir tikai aptuveni 0,11% no visiem gadījumiem. Kerala ir nosūtījusi vislielāko paraugu skaitu sekvencēšanai, aptuveni 5200, bet Karnataka, kurā ir salīdzināms gadījumu skaits, nosūtījusi tikai 137 paraugus. Tik zems genoma sekvencēšanas ātrums var nebūt statistiski nozīmīgs, lai izdarītu secinājumus par vīrusa mainīgo raksturu un uzvedību vai izstrādātu atbilstošus pasākumus epidēmijas izplatības ierobežošanai.

Šis raksts pirmo reizi tika publicēts drukātajā izdevumā 2021. gada 25. martā ar nosaukumu “Cracking the virus celma”.

Dalieties Ar Draugiem: