Paskaidrots: Izpratne par bagātīgo, ļoti transmisīvo koronavīrusa mutāciju
Covid-19 mutācijas: līdz šim pasaulē ir dokumentētas 12 000 mutāciju vairāk nekā 3,2 miljonos gadījumos. Viena mutācija ir konstatēta visizplatītākā. Pirmo reizi tas tika pamanīts Ķīnā un Vācijā.
RNS vīrusi, piemēram, SARS-CoV-2, mutē lēni, jo tiem ir nepieciešams saimnieks (cilvēka šūna), lai vairotos. (Failu fotoattēls/reprezentatīvs) Koronavīruss SARS-CoV-2 pastāvīgi mutē, taču viena mutācija īpaši ir pievērsusi pētnieku uzmanību tās pārpilnības dēļ. Šī mutācija, kas nosaukta par D614G, tika atklāta vairāk pārnēsājama nekā lielākā daļa citu.
Kas ir D614G mutācija?
Visi vīrusi mutē, lai pielāgotos cilvēku radītajām barjerām. RNS vīrusi, piemēram, SARS-CoV-2, mutē lēni, jo tiem ir nepieciešams saimnieks (cilvēka šūna), lai vairotos.
Līdz šim visā pasaulē ir dokumentētas 12 000 mutāciju vairāk nekā 3,2 miljonos gadījumos. Viena mutācija ir konstatēta visizplatītākā. Pirmo reizi tas tika pamanīts Ķīnā un Vācijā, bet ieguva uzmanību, kad tas vairākos gadījumos parādījās visā Eiropā un galu galā arī ASV, Kanādā, Austrālijā un Indijā. Šajā mutācijā glicīns (G) aizstāj asparagīnskābi (D), kas atrodas aminoskābes 614. pozīcijā. Tāpēc mutāciju sāka saukt par “D614G”.
IND614G,G (glicīns) aizstāj D (asparagīnskābi) 614. pozīcijā. (Korberet al/Cell) Ar ko šī mutācija atšķiras no citām?
Lai to saprastu, mums ir jāsaprot, kā SARS-CoV-2 nonāk cilvēka šūnā. Aminoskābes, kurās notiek mutācija, atrodas vīrusa smailes proteīnā. Smailes proteīni cilvēka šūnā saistās ar ACE2 receptoriem un iekļūst.
Dr Rajesh Pandey, CSIR genomikas un integratīvās bioloģijas institūta zinātnieks, paskaidroja, ka smailes proteīnā esošie peptīdi savienojas ar ACE2 receptoru. D614G mutācijas gadījumā atveras divi no trim peptīdiem, kas palielina iespēju iekļūt cilvēka šūnā. Iedomājieties roku ar trim pirkstiem. Ja tiek atvērts tikai viens pirksts, tam ir ierobežota piekļuve objektu paņemšanai, bet, ja tiek atvērti divi pirksti, tie var uzņemt vairāk objektu. Abi peptīdi palielina vīrusa iekļūšanas iespēju cilvēka šūnā.
Tā kā D614G raksturs nodrošina labākas iespējas iekļūt saimniekšūnā nekā citiem mutētiem celmiem, D614G ir lielāks transmisijas ātrums. GISAID, globāla vīrusu datubāze, kurā ir dokumentēti visi cirkulējošie SARS-CoV2 celmi, liecina, ka mutācijas celms Eiropā ir kļuvis nozīmīgs, sākot no marta.
Izskaidrotstagad ir ieslēgtsTelegramma. Klikšķis šeit, lai pievienotos mūsu kanālam (@ieexplained) un esiet informēts par jaunāko
Kādas ir šīs sekas?
Vīruss mutē katru reizi, kad tas vairojas cilvēka šūnā, lai pielāgotos un izdzīvotu. Šī mutācija palīdz vīrusam darīt tieši to. Līdz marta sākumam šī mutācija bija reta, bet ieguva dominējošo stāvokli Eiropā, liecina GISAID dati.
james cameron neto vērtība
Cell dokumentā tika novērots: līdz 2020. gada 1. martam tas (D614G) tika atrasts 10% no 997 globālajām sekvencēm; no 2020. gada 1. marta līdz 31. martam tas pārstāvēja 67% no 14 951 sekvences; un no 2020. gada 1. aprīļa līdz 18. maijam tas pārstāvēja 78% no 12 194 sekvencēm.
Medrxiv drukāšanas papīrs atklāja, ka pacientiem, kuri bija inficēti ar šo mutāciju, sākotnējās diagnozes laikā bija ievērojami lielāka vīrusu slodze nazofarneksā. Pētījumā Hjūstonā tika sekvencēti 5085 SARS-CoV-2 celmu genomi.
Celms ir pieaudzis, ātri pārnēsāts, jo tas viegli iekļūst šūnā. Tieši tas radīja popularitāti, sacīja mikrobiologs Dr Jayanthi Shastri no Kasturba laboratorijas Mumbajā. Šastri sacīja, ka sākotnējie pētījumi parādīja, ka D614G var izraisīt vairāk transmisijas un nopietnus simptomus. Sākotnēji mēs redzējām smagu infekciozitāti, taču laika gaitā mūsu paraugos ir redzams, ka infekciozitāti nevar tieši saistīt ar mutāciju, arī citiem blakusslimību faktoriem ir nozīme, viņa sacīja. Pagaidām nav pietiekami daudz garengriezuma pētījumu, lai izveidotu tiešu saikni starp D614G un palielinātu mirstību. Šim nolūkam mums ir jāveic genoma sekvencēšana vairākiem smagiem pacientiem, lai pārbaudītu, vai šī mutācija ir klāt, sacīja Šastri.
Arī sadaļā Izskaidrots | Jauns pētījums: pierādīts, ka ar kalciju bagāti deguna sāļi samazina izelpotā aerosolu
Vai tas ir izplatīts Indijā?
The Lancet publicēja iepriekšēju izdruku par Covid-19 atkārtotu inficēšanos četriem veselības darbiniekiem Mumbajā. Kasturbas slimnīcas, Starptautiskā gēnu inženierijas un biotehnoloģijas centra un CSIR – Genomikas un integratīvās bioloģijas institūta pētījums atklāja D614G mutāciju trijos no tiem. Vienam ārstam, kurš atkārtoti inficējās otro reizi, bija D614G mutācija. Viņam parādījās smagi simptomi un bija nepieciešama plazmas terapija. Taču mēs nevaram būt pārliecināti, ka D614G tieši saistīsim ar infekcijas smagumu, sacīja Šastri.
Citam ārstam D614G bija pirmajā infekcijā, taču tas neizraisīja smagus simptomus.
Nav pilnībā zināms, vai mutācija var izraisīt nāvi vai to var novērst ar vakcīnām. Daži pētījumi liecina, ka tas neizraisa smagu infekciju plaušās.
Vai tas ir vakcinācijas mērķis?
Tās pārpilnība sniedz pētniekiem iespēju izpētīt un mērķēt tā mehānismu. Pfizer strādā pie vakcīnas kandidāta, kurā antivielas bloķēs vīrusa receptoru saistošo domēnu. Vakcīnas Vācijas izmēģinājums ir parādījis daudzsološus rezultātus pret D614G celmu.
Pirmsdrukas papīrs Biorxiv 2. septembrī bija optimistisks, ka mutācija var nesamazināt vakcīnas efektivitāti pret to.
Dalieties Ar Draugiem:
