Paskaidrots: mutācijas koronavīruss pret testiem, vakcīnām

Jaunas koronavīrusa un Covid-19 vakcīnas un testi: Apvienotajā Karalistē cirkulējošo koronavīrusa variantu nosaka daudzas mutācijas. Kuras no tām rada īpašas bažas? Kāpēc PVO ir ieteikusi, ka tā var izvairīties no dažiem PCR testiem, un vai tas var ietekmēt vakcināciju?

Pfizer-BioNTech Covid-19 vakcīnas flakons Gaja slimnīcā Londonā. Lai gan vīruss dažos apgabalos ir mutējis, lielākā daļa vakcīnu ir vērstas uz vairākām daļām. (AP foto: Frenks Augšteins)

Jaunajā informācijā par jauno koronavīrusa SARS-CoV-2 variantu, kas cirkulē Apvienotajā Karalistē, viena mutācija ir radījis īpašas bažas. Variantu, ko sauc par VUI 202012/01 un par kuru ziņots, ka tas spēj ātrāk pārraidīt starp cilvēkiem, nosaka pat 14 mutācijas un trīs svītrojumi tā ģenētiskajā materiālā. Īpašas bažas rada viena mutācija N501Y. Lai gan varianta potenciāls ietekmēt testu un vakcinācijas rezultātus joprojām tiek pētīts, veselības aizsardzības iestādes lielākoties ir optimistiskas, ka lielākā daļa testu un vakcīnu joprojām darbosies.

Kas ir mutācija?

Mutācija nozīmē izmaiņas ģenētiskajā materiālā. RNS vīrusā, piemēram, SARS-CoV-2, olbaltumvielas sastāv no aminoskābju secības. Šāds vīruss satur aptuveni 30 000 “bāzes pāru”, kas ir kā ķieģeļi, kas novietoti viens otram blakus, veidojot struktūru. Šīs bāzes izmaiņas var būt mutācija, kas efektīvi maina vīrusa formu un uzvedību.

Apvienotās Karalistes variantā viena mutācija ir palielinājusi vīrusa saistību ar cilvēka proteīniem, ko sauc par receptoriem. To sauc par N501Y.

Kas ir N501Y?

Vienkāršiem vārdiem sakot, aminoskābe, kas apzīmēta ar burtu N un atrodas 501. pozīcijā koronavīrusa ģenētiskajā struktūrā, šajā pozīcijā ir aizstāta ar citu aminoskābi, ko apzīmē ar Y. Pozīcija, kurā ir notikušas šīs izmaiņas, ir smaile proteīna receptorus saistošais domēns. (Tas ir vīrusa smailes proteīns, kas saistās ar cilvēka receptoru.)

Tāpēc mutācija ir palielinājusi koronavīrusa saistīšanās afinitāti. Tiek ziņots, ka mutācijas vīruss izraisa 60% no nesenajām infekcijām Londonā.

Saskaņā ar Pasaules iniciatīvu putnu gripas datu kopīgošanai (GISAID) vairākās valstīs, tostarp Dienvidāfrikā un Austrālijā, ir neatkarīgi ziņots par to pašu mutāciju receptoru saistošajā domēnā. Secību analīze ir parādījusi, ka šī mutācija radās atsevišķi Apvienotajā Karalistē un Dienvidāfrikā.

Kā ir ar citām koronavīrusa mutācijām?

Mutācijas ir izplatītas, taču lielākā daļa no tām neizraisa izmaiņas to kodēto proteīnu struktūrā — tās sauc par “sinonīmām” mutācijām, jo ​​tās galu galā pārvēršas par tām pašām aminoskābēm. Cits veids ir “nesinonīma” mutācija, kas var izraisīt aminoskābju izmaiņas.

Apvienotajā Karalistē cirkulējošajā variantā ir sešas sinonīmiskas izmaiņas un četrpadsmit nesinonīmas mutācijas. Turklāt ir trīs “delecijas” — no secības izņemtas aminoskābes.

Saskaņā ar Pasaules Veselības organizācijas (PVO) datiem, izņemot N501Y, mutācijas, kas var ietekmēt vīrusa pārnešanu uz cilvēkiem, ir P681H un HV 69/70.

Un kas ir P681H un HV 69/70?

P681H : šī mutācija ir notikusi aminoskābē, kas atrodas pie 681. — citā vietā receptorus saistošajā domēnā. Šeit aminoskābe P ir aizstāta ar H. ASV Slimību kontroles centri (CDC) ir paziņojuši, ka šī ir vieta ar lielu koronavīrusu mainīgumu, un arī šī specifiskā mutācija ir spontāni parādījusies vairākas reizes. PVO ir paziņojusi, ka šai mutācijai ir bioloģiska nozīme.

Pētnieki jau iepriekš ir pierādījuši, ka šī mutācija var veicināt iekļūšanu elpceļu epitēlija šūnās un transmisiju dzīvnieku modeļos.

Jaunākie paraugi, kas sekvencēti Āfrikas Infekcijas slimību genomikas izcilības centrā, Redeemera universitātē, Nigērijā, ir parādījuši P681H secību. Tomēr pētnieki saka, ka pašlaik viņiem nav pierādījumu, kas liecinātu, ka P681H variants veicina vīrusa pārnešanas palielināšanos Nigērijā.

HV 69/70 : Šī mutācija ir aminoskābju dzēšanas rezultāts 69. un 70. pozīcijā. Šīs pozīcijas atkal atrodas vīrusa smaile. Šī dzēšana ir novērota arī Francijā un Dienvidāfrikā. CDC ir teicis: šī dubultā dzēšana ir notikusi spontāni daudzas reizes un, visticamāk, noved pie smailes proteīna formas (t.i., konformācijas izmaiņām).

Pētnieki COVID-19 Genomics Consortium UK (CoG-UK) vārdā, kas Apvienotajā Karalistē iezīmēja jauno variantu ar sarkanu karogu, savā provizoriskajā ziņojumā ir norādījuši, ka šī svītrošana tika novērota arī ar ūdelēm saistītā uzliesmojuma gadījumā Dānijā. Cilvēkiem šī dzēšana ir saistīta ar citu mutāciju N439K, kas atkal radās receptoru saistošajā domēnā.

PVO ir uzsvērusi, ka šī dzēšana var ietekmēt dažu RT-PCR testu veiktspēju, kas atklāj jauno koronavīrusu.

Kā tas var ietekmēt RT-PCR testus?

PVO ir paziņojusi, ka ir konstatēts, ka dzēšana pozīcijās 69/70 ietekmē dažu diagnostisko PCR analīžu veiktspēju, kurās izmanto 'S gēna mērķi' ('S' vai smailes proteīnā). Tomēr PVO ir arī paziņojusi, ka lielākajā daļā PCR testu visā pasaulē tiek izmantoti vairāki mērķi, un tāpēc nav paredzams, ka varianta ietekme uz diagnostiku būs nozīmīga.

Arī CDC ir teicis, ka lielākajai daļai komerciālo PCR testu ir vairāki mērķi, kuros tie atklāj vīrusu, tāpēc pat tad, ja mutācija ietekmē vienu no mērķiem, pārējie PCR mērķi joprojām darbosies.

Faktiski infekcija, ko izraisīja jaunais celms arī Apvienotajā Karalistē, tika atklāta ar parasto RT-PCR testu.

Šī iespējamā problēma ir jāapzinās arī laboratorijām, kuras izmanto iekšējas PCR pārbaudes, kuru mērķis ir vīrusa S gēns. Lai ierobežotu ietekmi uz noteikšanas spējām valstīs, ir ieteicama pieeja, izmantojot dažādus testus paralēlos vai multipleksos testos, kas mērķēti uz dažādiem vīrusu gēniem, lai ļautu noteikt potenciāli radušos variantus, ieteica PVO.

Vai tas ietekmēs vakcīnas izstrādi?

CDC ir paziņojis, ka ASV Pārtikas un zāļu pārvaldes (FDA) apstiprinātās vakcīnas ir poliklonālas, ražojot antivielas, kas ir vērstas pret vairākām smailo proteīna daļām.

Vīrusam, visticamāk, būs jāuzkrāj vairākas mutācijas smailes proteīnā, lai izvairītos no imunitātes, ko izraisa vakcīnas vai dabiska infekcija, teikts.

Un PVO ir teikusi: turpinās laboratorijas pētījumi, lai noteiktu, vai šiem vīrusu variantiem ir atšķirīgas bioloģiskās īpašības vai tie maina vakcīnas efektivitāti. Pašlaik nav pietiekami daudz informācijas, lai noteiktu, vai šis variants ir saistīts ar klīniskās slimības smaguma, antivielu atbildes reakcijas vai vakcīnas efektivitātes izmaiņām.

demi lovato networth

Dalieties Ar Draugiem: