Paskaidrots: kā darbojas koronavīrusa (COVID-19) tests

Kā PCR tests meklē vīrusu uztriepju paraugos? Cik ilgs laiks nepieciešams? Cik paraugu Indija pārbauda katru dienu, un vai tā var pārbaudīt vairāk? Ja var, kāpēc tas vēl nav palielināts?

Indija pašlaik veic divpakāpju reāllaika PCR, lai pārbaudītu SARS-COV-2. (Reuters)

Kāds ir jaunā koronavīrusa, kas izraisa COVID-19, diagnostikas tests?

The Indijas Medicīnas pētījumu padome (ICMR) ir paziņojusi par izraudzītajām laboratorijām izmantos parasto reāllaika polimerāzes ķēdes reakcijas (PCR) testu, ko veic ar tamponu, kas savākts no rīkles aizmugures, šķidra parauga no apakšējo elpceļu vai vienkāršu siekalu paraugu. Šādus testus parasti izmanto A, B un H1N1 gripas vīrusu noteikšanā.

Kas ir PCR tests?

Tas izmanto paņēmienu, kas rada DNS segmenta kopijas. “Polimerāze” attiecas uz fermentiem, kas veido DNS kopijas. 'Ķēdes reakcija' ir tas, kā DNS fragmenti tiek kopēti eksponenciāli - viens tiek kopēts divās, divi tiek kopēti četros utt. Karijs Mulliss, amerikāņu bioķīmiķis, kurš izgudroja PCR tehniku, 1993. gadā saņēma Nobela prēmiju ķīmijā.

Tomēr SARS-COV-2 ir vīruss, kas izgatavots no RNS, kas jāpārvērš DNS. Šim nolūkam tehnika ietver procesu, ko sauc par reverso transkripciju. 'Reversās transkriptāzes' enzīms pārvērš RNS DNS. Pēc tam tiek izgatavotas un pastiprinātas DNS kopijas. Fluorescējoša DNS saistoša krāsa, ko sauc par zondi, parāda vīrusa klātbūtni. Tests arī atšķir SARS-COV-2 no citiem vīrusiem.

Cik ilgi ilgst PCR process?

Reāllaika PCR ir samazinājis paraugu pārbaudes laiku līdz 4,5 stundām, salīdzinot ar aptuveni 6 stundām agrāk, sacīja ICMR zinātnieks Dr. R. R. Gangakhedkars. Tomēr kopējais apstrādes laiks — no paraugu savākšanas līdz ziņojuma iesniegšanai — ir aptuveni 24 stundas, un tam vajadzētu būt mazākam, viņš teica.

Paskaidrots: Pieci soļi koronavīrusa noteikšanai

Kā tests tiek veikts Indijā?

Indija pašlaik veic divpakāpju reāllaika PCR, lai pārbaudītu SARS-COV-2, sacīja NIMHANS vecākais profesors un neiroviroloģijas vadītājs Dr V Ravi. Pirmais posms ir paredzēts, lai atklātu ģenētiskos elementus, kas ir raksturīgi cilvēka koronavīrusiem, kas var pastāvēt paraugā. Otrais posms ir paredzēts, lai pārbaudītu konkrētus gēnus, kas atrodas tikai SARS-COV-2 vīrusā.

Līdz marta sākumam plkst sākotnējā skrīnings testu, lai pārbaudītu jebkāda veida koronavīrusu, veica visas laboratorijas, bet apstiprinošo PCR veica tikai Punes Nacionālais virusoloģijas institūts. Pēc tam NIV Pune nosūtīja tehnoloģiju (apstiprinājumam nepieciešamie reaģenti) uz visām laboratorijām, lai nebūtu nepieciešams paraugam nokļūt līdz Pūnai. Tas ir samazinājis laiku, kas nepieciešams paraugu pārbaudei, sacīja Dr Ravi.

Koronavīrusa pārbaude: šajā ilustrācijā, kas uzņemta 2020. gada 17. martā, mēģenēs ir redzamas viltotas asinis, kas marķētas ar koronavīrusu (COVID-19). (Reuters ilustrācija: Dado RuvicO

Vai Indija pārbauda pietiekami daudz skaitļu?

Indijai ir iespēja katru dienu pārbaudīt 10 000 paraugu, un pašlaik tiek pārbaudīti aptuveni 600–700. Salīdzinājumam, Dienvidkoreja, kurai ir līdzīgs izpildes laiks, tiek ziņots, ka testē līdz pat 20 000 paraugu dienā, īpaši izmantojot tādus modeļus kā tās caurbraukšanas testēšanas iekārtas.

Valdība apgalvo, ka šajā posmā nav nepieciešams pārbaudīt katru cilvēku. Valsts pārbauda kohortu, kas tai šobrīd ir jāpārbauda, ​​sacīja Dr Gangakhedkars. Ja izmantojat lokalizētu pārraidi, mēs pietiekami pārbaudām. Ja uzskatāt, ka pastāv kopienas pārraide, tā ir cita problēma. Joprojām nav pierādījumu, ka mēs nezinātu, kā indekss ir ieguvis šo infekciju, viņš teica.

emun elliott zvaigžņu kari

Express Explained tagad ir pieejams Telegram. Klikšķis šeit, lai pievienotos mūsu kanālam (@ieexplained) un esiet informēts par jaunāko

Mēs nevēlamies veikt neviennozīmīgu testēšanu, jo tagad visi pieprasa pārbaudi. Tātad kaut kur mums tas būs jāracionalizē… bet ir svarīgi arī sekot līdzi, lai mēs nepalaistu garām sabiedrības pārraidi, pagājušajā nedēļā preses brīfingā sacīja ICMR zinātniece Dr. Nivedita Gupta.

cik nopelna matēts lauers

Kāda būs stratēģija, ja notiks kopienas pārnešana?

ICMR veic uzraudzību, lai atklātu jebkādus pierādījumus par pārnešanu sabiedrībā, katrā no 52 Indijas testēšanas laboratorijām pārbaudot 20 izlases paraugus pacientiem ar smagu akūtu elpceļu infekciju (SARI). Paredzams, ka šo testu 'pirmais griezums' tiks publicēts trešdien. ICMR ir teicis, ka gadījumā, ja no šiem uzraudzības testiem tiks atklāts sabiedrības pārnešanas gadījums, valdības stratēģijas būs pilnīgi atšķirīgas.

Koronavīrusa pandēmija: slimnīcā Ņūdeli. (PTI fotoattēls/fails)

Vai pastāv šķēršļi testēšanas palielināšanai?

Daži eksperti uzskata, ka izmaksas ir potenciāls šķērslis. ICMR amatpersonas konferencē sacīja, ka primārā COVID-19 testa izmaksas ir 1500 Rs. Ja ir jāveic otrā pārbaude, lai apstiprinātu pirmās pārbaudes rezultātus, kopējās izmaksas ir aptuveni 5000 Rs. Viena no amatpersonām arī bija sacījusi, ka izmantotās zondes, kas ievestas no Vācijas, ir ierobežojošs faktors.

Kamēr ir palielināts testēšanas centru skaits, ir pieaudzis arī zondu imports. Pagājušajā nedēļā Indija vēlējās importēt aptuveni 200 000 zondes, savukārt pirmdien Dr Gangakhedkar teica, ka valdība plāno importēt aptuveni miljonu.

Koronavīrusa pandēmija: kad un kam veikt testu

Vai Indija varētu darīt lietas savādāk?

Indija bija sākusi darīt tieši to, ko ieteica valstij, kurā slimība tika importēta, norāda Indijas Translational Health Science and Technology Institute izpilddirektors Dr Gagandeep Kang. Tomēr to personu pārbaude un novērošana, kas ierodas valstī, un to personu uzraudzība, ar kurām viņi ir nonākuši saskarē, ir racionāla un piemērota pieeja, ja vienīgais risks bija slimības ievešana, un novērošana un pārbaude bija 100 %, viņa teica.

Taču tas, kas var notikt, ir tas, ka ar šo infekciju jūs varat izdalīties pat pirms simptomu parādīšanās, un tikai dažos gadījumos jums var nebūt simptomu, tāpēc jūs varat to pārnest uz citiem cilvēkiem, nezinot, ka esat inficēts, viņa sacīja. Šāda veida sarežģītība liek domāt par rezerves stratēģijas izveidi, lai redzētu, vai tiešām esat kaut ko palaidis garām, viņa teica. Mēs varētu darīt vairāk.

Vai ICMR novērošana palīdzēs?

ICMR lēmums ir labs solis, taču ir reģioni, kurus šādas mācības pēc tam atstātu ārpusē, sacīja Dr Kangs. Ja katru nedēļu pārbaudāt paraugus no katras gripas laboratorijas, tad, ja atrodat kaut vienu pozitīvu, tas jums pateiks, ka esat daudz ko palaidis garām, viņa sacīja.

Pēc Dr Kanga teiktā, ir iespējams izmantot matemātisko modelēšanu, lai saprastu, kas valdībai dotu saprātīgu iespēju noteikt, vai jau pastāv kāda kopienas pārraide. Manuprāt, būtu lieliski, ja būtu tāds modelis, kāds ir Singapūrā, kur jebkurš ārsts, kuram bija klīniskas aizdomas, pat ja tas neatbilst aprakstam, drīkstētu nosūtīt savu pacientu uz pārbaudi, viņa piebilda.

– Kauņas šerifa M

Dalieties Ar Draugiem: